如若海南公司税务异常该怎么处理，其可以通过以下操作方法来进行处理，具体流程如下：

　　(1)企业提供税务异常情况说明和解除税务非正常状态的正当理由。

　　(2)办税服务厅接收申请材料，核对纳税人报送材料是否齐全、是否符合法定形式，符合的受理。不符合的驳回，并告知纳税人应补正资料或不受理原因。

　　(3)相关部门调查核实相关情况。

　　(4)纳税人补充申报、补缴税款、滞纳金、罚款。

　　(5)办税服务厅根据管理部门反馈情况，在纳税人补充申报、补缴税款、滞纳金、罚款后，解除纳税人非正常状态。

　　(6)对已宣布其税务登记证件失效的纳税人收缴原税务登记证件，并重新发放税务登记证件。